工伤认定难申请的原因主要有以下几点：
劳动关系认定复杂
劳动者与用人单位的劳动关系可能涉及多种复杂形式，如劳务派遣、劳务外包等，需要细致梳理双方的权利义务关系。
用人单位可能不规范用工，劳动者缺乏保留证据的意识，导致劳动关系难以认定。
工伤赔偿主体确定困难
非法用工主体大量存在，这些主体不具备用人资质，但以用人单位名义招用农民工，给工伤认定带来难题。
劳动者法制观念淡薄，可能选择私了、拖延或忍气吞声，延误工伤认定时机。
证据收集困难
工伤事故发生后，现场可能被破坏，证人难以找到，劳动者难以提供充分证据证明受伤与工作之间的直接因果关系。
劳动者手中通常没有劳动合同，搜集证据时需要用人单位和同事的配合，增加了难度。
法律程序繁琐
从申请工伤认定到最终作出认定决定，需要经过多个环节和程序，每个环节都有严格的时间要求和规定，导致工伤认定过程漫长。
法律法规滞后
现行的《工伤保险条例》规定的认定与不认定工伤的情形过于原则、笼统，无法完全概括工伤的内涵和外延，增加了劳动部门的工伤认定难度和自由裁量权。
用人单位不配合
部分用人单位为了减少成本，可能故意拖延或拒绝提供相关证据，甚至否认工伤事实，增加了工伤认定的难度和时间成本。
综上所述，工伤认定难申请的原因是多方面的，涉及劳动关系认定、工伤赔偿主体确定、证据收集、法律程序繁琐以及法律法规滞后等多个因素。为了改善这一现状，需要各方共同努力，完善相关制度和流程，提高工伤认定工作的规范性和效率。
