绩效工资为负数的原因可能包括以下几点：
医院待遇分配问题
基本工资一半为保底工资，另一半按绩效发放。由于病源少，绩效部分很少，可能导致整体工资水平较低，甚至出现负数。
DRG付费问题
医院收入虽高，但扣费更多，导致医院营收为负数。科室需要承担新科室引进设备、器械、水电、耗材等费用，这些费用从科室的绩效中扣除，使得绩效变成负数。
医院建设和财务压力
医院正在建设新楼，花费大量财力，需要用钱。同时，医院欠供货商和器械商的钱，估计有9位数以上，这些财务压力也会转嫁到科室和员工的绩效上。
劳动合同和公司规章制度
如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了绩效倒扣工资的方式及额度，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么在符合规定的情况下，绩效倒扣工资为负数是合法的。然而，如果医院没有明确的规定，或者规定的绩效倒扣方式不合理、不公正，例如随意大幅扣除工资导致员工工资低于当地最低工资标准，或者扣除行为存在欺诈、胁迫等违法情形，那么这种绩效倒扣工资为负数的行为就是违法的。
绩效评估和管理问题
当绩效评估结果出现全员负数时，可能是目标设置不合理、评价体系失衡、沟通不足或市场及外部因素的影响。例如，过高的业绩指标、偏向某一维度的考核标准、缺乏透明公正的反馈机制，以及经济衰退、行业剧变等不可抗力因素，都可能导致全员绩效下滑。
建议
合理设定绩效指标：医院应设定合理的业绩指标，确保员工能够达到，以维持其积极性和工作动力。
完善薪酬体系：医院需要完善薪酬体系，明确绩效工资的计算方式和可倒扣的范围，确保倒扣工资的行为合法且合理。
加强沟通：建立透明、公正的反馈机制，确保员工对考核过程及其目的有充分的了解，增强参与度和公平感。
财务透明：医院应对其财务状况进行透明化管理，减少不必要的开支，减轻科室和员工的财务压力。
法律合规：医院应确保所有薪酬操作符合《劳动合同法》等相关法律法规，避免违法行为的发生。
